国内在采用酶解提取法酶解鸡腿骨制备硫酸软骨素时，采用的酶制剂有来源于猪胰脏的蛋白酶、植物提取来源的木瓜蛋白酶以及微生物来源的碱性蛋白酶或者中性蛋白酶等。但在酶解这一环节，酶制剂的选择是很重要的。采用不同的酶制剂对鸡腿骨酶解，得到的效果是不一样的。若采用猪胰脏来源的蛋白酶处理，则原料价格不好控制，且胰脏存在酶活不稳定性，不利于标准化生产，而单用植物或者微生物来源的酶制剂做提取，其硫酸软骨素产品的收率并不高，因此，为了更注重产品质量、收率和优化生物资源的综合利用情况之下，很多企业采用复合酶---硫酸软骨素专用酶对鸡腿骨酶解，从而提高硫酸软骨素收率。